Pour répondre aux besoins de la filière viti-vinicole, Microflora a développé et applique un ensemble d’outils de diagnostic directement issus des résultats du laboratoire de Recherche. Beaucoup s'appuient sur des méthodes moléculaires et sur des protocoles innovants, identifiant les microorganismes de façon très spécifique. Ponctuellement, nous réalisons des analyses plus classiques (microscopie, cultures), afin de compléter les diagnostics microbiologiques demandés.
Quelques prestations de service…
- Analyse de troubles et dépôts dans les boissons
- Dénombrement des microorganismes d'intérêt œnologique et de microorganismes d’altération
- Accompagnement pour le suivi microbiologique depuis les vendanges jusqu'à la mise en bouteille.
Analyses microscopiques
- Observation microscopique directe
- Dénombrement de microorganismes viables et non viables par épifluorescence
- Mesure de la taille de cellules
Contrôles d’implantation de levains œnologiques
- Levures (PCR δ) :Détermination du pourcentage du levain parmi toutes les souches de S. cerevisiae
- Recherche des levures des espèces T. delbrueckii/ M. pulcherrima/H. uvarum/B. bruxellensis/S. cerevisiae et/ou L. thermotolerans (MALDI-TOF/MS ou PCR spécifique)
Détermination du pourcentage de T. delbrueckii/ M. pulcherrima/H. uvarum/B. bruxellensis/S. cerevisiae ou L. thermotolerans parmi toutes les autres levures
- Recherche des bactéries de l'espèce O. oeni et/ou L. plantarum (MALDI-TOF/MS ou PCR spécifique)
Détermination du pourcentage de L. plantarum et/ou O. oeni s parmi toutes les autres bactéries
- Diversité des espèces de levures ou de bactéries présentes par MALDI-TOF/MS (base de données spécifique à l'environnement viti-vinicole).
- Bactéries : VNTR (Nombre de séquences répétées) : Proportion du levain et autres souches d'O. oeni.
- Bactéries : REA-PFGE (« champs pulsés »): présence/absence du levain dans la biomasse totale pour les espèces O. oeni ou L. plantarum.
Détection spécifique et rapide de microorganismes par MALDI-TOF/MS ou PCR spécifique
Recherche et Détection des espèces de levures par MALDI-TOF/MS (base de données spécifique aux boissons développée en interne) :
- Brettanomyces bruxellensis
- Saccharomyces cerevisiae
- Torulaspora delbrueckii
- Metschnikowia pulcherrima
- H. uvarum
- …
Recherche et Détection des espèces de bactéries par MALDI-TOF/MS (base de données spécifique aux boissons développée en interne) ou PCR spécifique :
- Pediococcus damnosus , P. parvulus (détection des souches de la maladie de la graisse),
- Lactobacillus plantarum
- Bactéries de la maladie de l'amertume
- Bactéries productrices d'amines biogènes détection et quantification - Histamine-Putrescine- Tyramine- Cadaverine
Quantification rapide par q PCR
- Levures totales
- S. cerevisiae
- B. bruxellensis
- Bactéries acétiques
- Bactéries lactiques
- Botrytis cinerea
Différenciation de souches de microorganisme
- Etude de diversité des souches d’intérêt : S. cerevisiae (analyses de marqueurs microsatellites) ou O. oeni (analyses de marqueurs VNTRs)
- Différenciation de souche de levures par analyse de marqueurs microsatellites:
S. cerevisiae , B. bruxellensis, M. pulcherrima, S. uvarum, L. thermotolerans…
- Différenciation de souche de bactéries par analyses génétiques :
Lactobacillus plantarum, Pediocoques
Identification de microorganisme par MALDI-TOF/MS (base de données spécifique aux boissons développée en interne)
- Analyse de la diversité des espèces de levures de microorganismes présentes dans un échantillon de moût, de vin, d’eau de lavages, de bois…
- Identification de microorganisme (MALDI-TOF/MS et séquençage d'ADN)
Dénombrement de microorganismes sur milieu de culture
- Levures totales
- Levures non- Saccharomyces
- Bactéries lactiques
- Bactéries acétiques
- Moisissures…
- Analyse de conformité de LSA ou levain malolactique selon le Codex Œnologique (Recherche de Salmonelles, E.coli, Staphylocoques coagulase+, Coliformes, typage au niveau de la souche…)
Etudes à la carte
- Microorganismes présents à la surface des baies de raisin, des sols: identification au niveau de l'espèce, différenciation des souches possible...
- Analyse de la diversité métabolique des microorganismes des baies ou des sols (comparaison de la diversité microbienne lors d'itinéraires de conduite du vignoble distinsts)
- Comparaisons de capacités fermentaires de souches de levures ou de bactéries
- Impact de traitements sur les populations de levures retrouvées en fermentations spontanées
Bon à savoir :
Pour chaque type d'analyse , en général 100 mL de vin suffisent. Pour les produit solides, nous fournir au minimum 5 g de produit. Nous mettons à votre disposition des flacons stériles pour vos prélèvements.